萘乙酸钠高纯度α-萘乙酸钠纯度在98%以上，含有少量水分不含有其它有机杂质，因此在它有效使用浓度范围内不会对作物产生任何危害，而普通α-萘乙酸钠由于含有20%的有机杂质，在有效使用浓度范围内对植物的幼叶、幼芽、幼苗会产生危害。轻则导致黑色斑点，重则导致死亡，并且有一些有机杂质对人体和环境造成危害。对于任何一种植物生长调节剂和农药，其纯度与其效果均有关，比如高纯度α-萘乙酸钠5ppm（5ug/g）即具有很好的效果，而普通的Q一萘乙酸钠需达到20ppm（20I，Lg/g）才有效果。
高纯度α-萘乙酸钠具有水、油两溶性、因此可单独制成水剂、粉剂、乳油、粒剂等剂型，使用非常方便，效果非常好。因为它在溶液中是单分子存在的，分散均匀，易被植物吸收，而普通含量80%只能溶于油，使用很不方便。需用乙醇稀释等，其在乳油粉剂中是以分子团的状态存在的，分散性差，效果自然不好。
高纯度α-萘乙酸钠可以和很多植物生长调节剂复配使用，如：生长素、复硝酚钠、杀菌剂、肥料等；而普通的α-萘乙酸钠至今还没有其复配制剂。
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