市农协总会是负责全市农协（试验区）建设的机构，于是农村改革试验区领导小组为一个机构、两块牌子。
1.负责制定、实施全市农协、专协工作目标并负责督促、检查、落实。
2.负责指导基层农协（试验区）和各级专协的组织建设、规范化管理。指导协调各县（市）区农协和市直涉农部门围绕“三农”办好农协，围绕产业建好专协，大力开展产前、产中、产后系列化服务。
3.负责全市农村改革试验区领导小组及其办公室日常工作。负责指导县（市）区农村改革试验区建设，进一步探索农协、专协的组织形式、运行机制和龙头、基地、农户的利益连结机制，培育典型，搞好试验、示范和推广。
4.负责全市农协（试验区）系统工作人员的培训，组织有关专家开展技术咨询和专业技术培训。
5.负责全市农协系统信息服务网络建设。收集、筛选、发布农民急需的种植、养殖、加工和其他重要信息。